Vinculada à Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais (SES/MG), a Fundação Ezequiel Dias é administrada por quatro diretorias e pela Presidência.
Presidência
Atua de forma a integras as diretorias e estabelecer, em conjunto com os demais membros da admnistração, metas anuais; além de meios para garantir o alcance de resultados propostos para a promoção da saúde e desenvolvimento do Sistema único de Saúde (SUS).
Diretoria Industrial
Desenvolve, aperfeiçoa, produz e distribui medicamentos, soros e Vacina em atendimento prioritário a Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais – SES /MG e órgãos de outras instâncias do SUS.
Diretoria do Instituto Octávio Magalhães
Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais (Lacen/MG), referência nacional e regional, planeja, dirige, orienta, coordena, executa e avalia as atividades de Vigilância Sanitária, Epidemiológica, Ambiental, bem como desenvolve pesquisas, no âmbito da Funed.
Atua no controle de doenças, por meio do processo de investigação e inquérito, e realização de exames para diagnóstico de doenças de notificação compulsória como dengue, febre amarela, AIDS, tuberculose, dentre outras, sendo referência nacional para doença de Chagas; leishmaniose.
Atua também nas análises de alimentos, água, medicamentos, cosméticos, saneantes, e ambiente, sendo referência nacional também na análise de medicamentos.
Diretoria de Pesquisa e Desenvolvimento
Desenvolve conhecimento científico em assuntos de retorno social e técnicas e processos com o objetivo de melhorar a qualidade dos serviços e produtos desenvolvidos na instituição. Planeja, coordena, dirige, supervisiona, executa e avalia o desenvolvimento de pesquisas científicas e tecnológicas da Fundação Ezequiel Dias.
Basea-se no estudo da biodiversidade com foco em venenos e toxinas de animais peçonhentos e em plantas medicinais para o desenvolvimento de fármacos e outros produtos para a saúde humana.
Diretoria de Planejamento, Gestão e Finanças
Responsável por coordenar as atividades de planejamento, gestão e finanças, promovendo a implantação e o acompanhamento das políticas relativas à administração e desenvolvimento de pessoas, logística de apoio operacional, planejamento, orçamento, contabilidade, finanças e gestão da tecnologia e sistemas de informação.






